坪田・井上・中原-坪田・内田・向井 2015

提供: 広島大学デジタル博物館
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坪田ほか (2014)

文献(出典)

  • 坪田博美・井上侑哉・中原-坪田美保・内田慎治・向井誠二. 2014 (2015). 標本同定のツールとしてのDNAバーコーディング-植物標本の例-. 広島大学総合博物館研究報告 6: 41-49.

ノート

  • 広島大学植物標本庫に収蔵されていた維管束植物の標本についてDNAバーコーディングを行った.
  • 実際の出版は,2015年2月.

Abstract

Tsubota, H., Inoue, Y., Nakahara-Tsubota, M., Uchida, S. & Mukai, S. 2014 (2015). DNA barcoding as a supporting tool for identification of undetermined herbarium specimens, with special reference for dried plant specimens. Bull. Hiroshima Univ. Museum 6: 41-49.

要旨

坪田博美・井上侑哉・中原-坪田美保・内田慎治・向井誠二. 2014 (2015). 標本同定のツールとしてのDNAバーコーディング-植物標本の例-. 広島大学総合博物館研究報告 6: 41-49.

生 物 学 的 な 研 究 を 行 う 際 の 基 礎 資 料 と し て 標 本 は 必 要 不 可 欠 で あ る が , そ の 状 態 に よ っ て は 形 態 に よ る 同 定 が 困 難 な 場 合 が あ る 。 近 年 D N A バ ー コ ー デ ィ ン グ に よ る 種 の 同 定 が 行 わ れ る よ う に な っ て い る 。 今 回 , 広 島 大 学 植 物 標 本 庫 H I R O に 収 蔵 さ れ て い る 標 本 の う ち , 完 全 標 本 で な い も の を 対 象 に D N A バ ー コ ー デ ィ ン グ を 行 っ た 。 そ の 結 果 , 沖 縄 県 産 の 標 本 か ら 移 入 植 物 と 考 え ら れ る Ruellia longepetiolata ( O e r s t . ) H e m s l . を 確 認 し , D N A バ ー コ ー デ ィ ン グ が 標 本 の 管 理 に 有 効 で あ る こ と が 示 さ れ た 。 一 方 で , 沖 縄 産 の 標 本 か ら ハ イ ノ キ 属 Symplocos の 一 種 を 確 認 し た が , デ ー タ ベ ー ス に 登 録 さ れ て い る 配 列 と は 一 致 し な か っ た 。 こ の 標 本 に つ い て は 種 レ ベ ル の 同 定 を 行 う た め さ ら に 検 討 が 必 要 で あ る 。 こ の よ う な 場 合 , 形 態 の 検 討 が 重 要 で あ り , 配 列 デ ー タ だ け に 頼 っ た 判 断 に は 注 意 が 必 要 で あ る 。 本 研 究 の 結 果 , D N A バ ー コ ー デ ィ ン グ が , 完 全 で な い 標 本 の 同 定 に 有 効 で あ る こ と , そ の 際 に 分 子 系 統 解 析 を 併 用 す る こ と で さ ら に 効 果 が あ が る こ と , 配 列 情 報 だ け を 使 っ た 同 定 に も 限 界 が 存 在 す る こ と が 明 ら か に な っ た 。生 物 学 的 な 研 究 を 行 う 際 の 基 礎 資 料 と し て 標 本 は 必 要 不 可 欠 で あ る が , そ の 状 態 に よ っ て は 形 態 に よ る 同 定 が 困 難 な 場 合 が あ る 。 近 年 D N A バ ー コ ー デ ィ ン グ に よ る 種 の 同 定 が 行 わ れ る よ う に な っ て い る 。 今 回 , 広 島 大 学 植 物 標 本 庫 H I R O に 収 蔵 さ れ て い る 標 本 の う ち , 完 全 標 本 で な い も の を 対 象 に D N A バ ー コ ー デ ィ ン グ を 行 っ た 。 そ の 結 果 , 沖 縄 県 産 の 標 本 か ら 移 入 植 物 と 考 え ら れ る Ruellia longepetiolata ( O e r s t . ) H e m s l . を 確 認 し , D N A バ ー コ ー デ ィ ン グ が 標 本 の 管 理 に 有 効 で あ る こ と が 示 さ れ た 。 一 方 で , 沖 縄 産 の 標 本 か ら ハ イ ノ キ 属 Symplocos の 一 種 を 確 認 し た が , デ ー タ ベ ー ス に 登 録 さ れ て い る 配 列 と は 一 致 し な か っ た 。 こ の 標 本 に つ い て は 種 レ ベ ル の 同 定 を 行 う た め さ ら に 検 討 が 必 要 で あ る 。 こ の よ う な 場 合 , 形 態 の 検 討 が 重 要 で あ り , 配 列 デ ー タ だ け に 頼 っ た 判 断 に は 注 意 が 必 要 で あ る 。 本 研 究 の 結 果 , D N A バ ー コ ー デ ィ ン グ が , 完 全 で な い 標 本 の 同 定 に 有 効 で あ る こ と , そ の 際 に 分 子 系 統 解 析 を 併 用 す る こ と で さ ら に 効 果 が あ が る こ と , 配 列 情 報 だ け を 使 っ た 同 定 に も 限 界 が 存 在 す る こ と が 明 ら か に な っ た 。

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