PCR primers cp rbcL

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PCR primers

chloroplast

rbcL

Table. Primers used for PCR amplification and sequencing
Analyzed region Forward / Reverse Primer name Sequence (5'–3') References For
rbcL Forward atpB1011 GATCTACTAC TTTAATTCCT GT Tsubota et al. (1999) Bryopytes
rbcL Forward atpB370 AGTTGAATCT AAAGGATCTA C Tsubota et al. (1999) Bryopytes
rbcL Forward atbB175R TGTTGAACTT CACAAGTAAC A Manhart (1994) Bryopytes
rbcL Forward rbcL−130 ACAATGATAC TGTTTGTTAT AG Tsubota et al. (1999) Bryopytes
rbcL Forward rbcL−73 ATACCAAAGA TGTTTTTTTA TAAG Tsubota et al. (1999) Bryopytes
rbcL Forward rbcL7 TGGATTTAAA GCTGGTGTTA AAG Tsubota et al. (1999) Bryopytes
rbcL Forward HrL1 ATGTCACCAC AAACGGAGAC TAAAGCAGG Masuzaki et al. (2010) Bryopytes
rbcL Forward rbcL256 GCTATGATCT TGAAGCAGTT CCTGGAGAAG Tsubota et al. (2000) Bryopytes
rbcL Forward rbcL557 GGTAGAGCTG TATATGAATG TCTTCGTGGT GG Tsubota et al. (2000) Bryopytes
rbcL Forward rbcL919G CATGGTATGC ATTTCCGTGT A Tsubota et al. (2001) Bryopytes
rbcL Reverse trnRn GGGTTAGAAG GGATTCGAAC CCTTGAC Tsubota et al. (1999) Bryopytes
rbcL Reverse rbcL1346hR GCAGCTAATT CAGGACTCC Tsubota et al. (1999) Bryopytes
rbcL Reverse rbcL1301RL CTTCATTACG TGCTTGTACA CAAGCTTCTA Inoue et al. (2011) Bryopytes
rbcL Reverse rbcL1098R AACACCTGGT AAAGAAACC Tsubota et al. (1999) Bryopytes
rbcL Reverse rbcL600R GTGAAATCAA GTCCACCACG Tsubota et al. (1999) Bryopytes

nuclear

References

  • Handa, S., Nakahara, M., Tsubota, H., Deguchi, H. & Nakano, T. 2003. A new aerial alga, Stichococcus ampulliformis sp. nov. (Trebouxiophyceae, Chlorophyta) from Japan. Phycol. Res. 51: 203-210.
  • Taberlet, P., Gielly, L., Pautou, G. & Bouvet, J. 1991. Universal primers for amplification of three non-coding regions of chloroplast DNA. Plant Mol. Biol. 17: 1105-1109.
  • Tsubota, H., Kubo, H. & Mukai, S. 2009. A new finding of seagrass Halophila nipponica J.Kuo (Hydrocharitaceae) from Miyajima Island in Hiroshima Prefecture, SW Japan. Hikobia 15: 339-347 (in Japanese with English Abstract and Tables). [坪田博美・久保晴盛・向井誠二. 2009. 広島県宮島近海で見つかったヤマトウミヒルモHalophila nipponica J.Kuoについて. Hikobia 15: 339-347.]
  • Tsubota, H., Kubo, H., Takeuchi, K., Nakahara-Tsubota, M., Inoue, Y., Uchida, S. & Mukai, S. 2012. Notes on naturalized plants in Hiroshima Prefecture: 3. New locality and nrITS variation of Lactuca serriola L. (Asteraceae). Hikobia 16: 197-202 (in Japanese with English Abstract and Tables). [坪田博美・久保晴盛・武内一恵・中原-坪田美保・井上侑哉・内田慎治・向井誠二. 2012. 広島の帰化植物3.トゲヂシャとマルバトゲヂシャ. Hikobia 16: 197-202.]

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