「PCR primers cp rps4」の版間の差分

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| For
 
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| Bryophytes
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| Forward
 
| Forward
 
| rps5
 
| rps5
21行目: 28行目:
 
| Bryophytes
 
| Bryophytes
 
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| rps4
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|''rps4''
 
| Forward
 
| Forward
 
| rps4_1R
 
| rps4_1R
28行目: 35行目:
 
| Bryophytes
 
| Bryophytes
 
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| rps4
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|''rps4''
 
| Forward
 
| Forward
 
| rps4_2Fmas
 
| rps4_2Fmas
35行目: 42行目:
 
| Bryophytes
 
| Bryophytes
 
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|''rps4''
 
| Forward
 
| Forward
 
| rps4_19Fi
 
| rps4_19Fi
42行目: 49行目:
 
| Bryophytes
 
| Bryophytes
 
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| rps4
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|''rps4''
 
| Forward
 
| Forward
 
| rps4_275Fmas
 
| rps4_275Fmas
49行目: 56行目:
 
| Bryophytes
 
| Bryophytes
 
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| rps4
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|''rps4''
 
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| Forward
 
| rps4_347Fmas
 
| rps4_347Fmas
56行目: 63行目:
 
| Bryophytes
 
| Bryophytes
 
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| rps4
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|''rps4''
 
| Forward
 
| Forward
 
| rps4_553Fmas
 
| rps4_553Fmas
70行目: 77行目:
 
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| rps4
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|''rps4''
 
| Reverse
 
| Reverse
 
| psaA340F
 
| psaA340F
77行目: 84行目:
 
| Bryophytes
 
| Bryophytes
 
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| Reverse
 
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| trnS (syn. trans)
 
| trnS (syn. trans)
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| Vascular plants ([[Souza-Chies_et_al_1997|Souza-Chies et al. 1997]]), Bryophytes ([[Buck_et_al_2000|Buck et al. 2000, as trans]])
 
| Vascular plants ([[Souza-Chies_et_al_1997|Souza-Chies et al. 1997]]), Bryophytes ([[Buck_et_al_2000|Buck et al. 2000, as trans]])
 
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| rps4
+
|''rps4''
 
| Reverse
 
| Reverse
 
| rps4_609RL
 
| rps4_609RL
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| Bryophytes
 
| Bryophytes
 
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|''rps4''
 
| Reverse
 
| Reverse
 
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| psa3'
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| Bryophytes
 
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| Reverse
 
| Reverse
 
| rps4_602Fn (<strike>psa4_602Fn</strike>)
 
| rps4_602Fn (<strike>psa4_602Fn</strike>)
105行目: 112行目:
 
| Bryophytes
 
| Bryophytes
 
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|''rps4''
 
| Reverse
 
| Reverse
 
| rps4_605Rmas
 
| rps4_605Rmas
112行目: 119行目:
 
| Bryophytes
 
| Bryophytes
 
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|''rps4''
 
| Reverse
 
| Reverse
 
| rps4_578Ri
 
| rps4_578Ri
119行目: 126行目:
 
| Bryophytes
 
| Bryophytes
 
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| rps4
+
|''rps4''
 
| Reverse
 
| Reverse
 
| rps4_531Rmas
 
| rps4_531Rmas
126行目: 133行目:
 
| Bryophytes
 
| Bryophytes
 
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| rps4
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|''rps4''
 
| Reverse
 
| Reverse
 
| rps4_305Rmas
 
| rps4_305Rmas
134行目: 141行目:
 
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PCR primers

chloroplast

rps4

Table. Primers used for PCR amplification and sequencing
Analyzed region Forward / Reverse Primer name Sequence (5'–3') References For
rps4 Forward trnT36R GTAATGCGAT GGTCATCGGT TCGACTCCGA TA Inoue et al. (2012) Bryophytes
rps4 Forward rps5 ATGTCCCGTT ATCGAGGACC T Nadot et al. (1994) Bryophytes
rps4 Forward rps4_1R ATGTCCCGTT ATCGAGGACC TCGTGTA Inoue et al. (2012) Bryophytes
rps4 Forward rps4_2Fmas TGTCCCGTTA TCGAGGACC Masuzaki et al. (2010) Bryophytes
rps4 Forward rps4_19Fi CCTCGTGTAA GAATAATACG TC Inoue & Tsubota (2014) Bryophytes
rps4 Forward rps4_275Fmas AGATAATGTG ATCTTTCGAT TAGGTATGGC Masuzaki et al. (2010) Bryophytes
rps4 Forward rps4_347Fmas CAATTGGTTA ATCATAGACA Masuzaki et al. (2010) Bryophytes
rps4 Forward rps4_553Fmas CAAACGATTA ATCGTGAATG GA Masuzaki et al. (2010) Bryophytes
rps4 Reverse psaA340F CTTGAGCACT AGGTTTAATA TGAGTAGGAT CA Inoue et al. (2012) Bryophytes
rps4 Reverse trnS (syn. trans) TACCGAGGGT TCGAATC Souza-Chies et al. (1997), Buck et al. (2000) Vascular plants (Souza-Chies et al. 1997), Bryophytes (Buck et al. 2000, as trans)
rps4 Reverse rps4_609RL TTAAGCTTGA CGAGAATAAT ATTC Masuzaki et al. (2010) Bryophytes
rps4 Reverse psa3' ATATTCTACA ACTAACAACT C Nadot et al. (1994) Bryophytes
rps4 Reverse rps4_602Fn (psa4_602Fn) TGACGAGAAT AATATTCTAC AACTA Inoue & Tsubota (2014) Bryophytes
rps4 Reverse rps4_605Rmas ACTTGGCGAG AATAATATTC AAC Masuzaki et al. (2010) Bryophytes
rps4 Reverse rps4_578Ri CGAGAATAAT ATTCTACAAC TA Inoue & Tsubota (2014) Bryophytes
rps4 Reverse rps4_531Rmas TCCATTCACG ATTAATCGTT TG Masuzaki et al. (2010) Bryophytes
rps4 Reverse rps4_305Rmas GCCATACCTA ATCGAAAGAT CACATTATCT Masuzaki et al. (2010) Bryophytes

References

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