「PCR primers cp rps4-trnT-trnL-trnF」の版間の差分

提供: 広島大学デジタル博物館
ナビゲーションに移動検索に移動
(ページの作成:「<span style="font-size:10">[http://www.hiroshima-u.ac.jp/index-j.html 広島大学] > [http://www.digital-museum.hiroshima-u.ac.jp/~museum/ デジタル自然史博物館...」)
 
14行目: 14行目:
 
| For
 
| For
 
|-
 
|-
| rps4
+
|''rps4''
 
| Forward
 
| Forward
 
| rps5
 
| rps5
21行目: 21行目:
 
| Bryophytes
 
| Bryophytes
 
|-
 
|-
| rps4
+
|''rps4''
 
| Forward
 
| Forward
 
| rps4_1R
 
| rps4_1R
28行目: 28行目:
 
| Bryophytes
 
| Bryophytes
 
|-
 
|-
| rps4
+
|''rps4''
 
| Forward
 
| Forward
 
| rps4_2Fmas
 
| rps4_2Fmas
35行目: 35行目:
 
| Bryophytes
 
| Bryophytes
 
|-
 
|-
| rps4
+
|''rps4''
 
| Forward
 
| Forward
 
| rps4_19Fi
 
| rps4_19Fi
42行目: 42行目:
 
| Bryophytes
 
| Bryophytes
 
|-
 
|-
| rps4
+
|''rps4''
 
| Forward
 
| Forward
 
| rps4_275Fmas
 
| rps4_275Fmas
49行目: 49行目:
 
| Bryophytes
 
| Bryophytes
 
|-
 
|-
| rps4
+
|''rps4''
 
| Forward
 
| Forward
 
| rps4_347Fmas
 
| rps4_347Fmas
56行目: 56行目:
 
| Bryophytes
 
| Bryophytes
 
|-
 
|-
| rps4
+
|''rps4''
 
| Forward
 
| Forward
 
| rps4_553Fmas
 
| rps4_553Fmas
70行目: 70行目:
 
|
 
|
 
|-
 
|-
| rps4
+
|''rps4''
 
| Reverse
 
| Reverse
 
| psaA340F
 
| psaA340F
77行目: 77行目:
 
| Bryophytes
 
| Bryophytes
 
|-
 
|-
| rps4
+
|''rps4''
 
| Reverse
 
| Reverse
 
| trnS (syn. trans)
 
| trnS (syn. trans)
84行目: 84行目:
 
| Vascular plants ([[Souza-Chies_et_al_1997|Souza-Chies et al. 1997]]), Bryophytes ([[Buck_et_al_2000|Buck et al. 2000, as trans]])
 
| Vascular plants ([[Souza-Chies_et_al_1997|Souza-Chies et al. 1997]]), Bryophytes ([[Buck_et_al_2000|Buck et al. 2000, as trans]])
 
|-
 
|-
| rps4
+
|''rps4''
 
| Reverse
 
| Reverse
 
| rps4_609RL
 
| rps4_609RL
91行目: 91行目:
 
| Bryophytes
 
| Bryophytes
 
|-
 
|-
| rps4
+
|''rps4''
 
| Reverse
 
| Reverse
 
| psa3'
 
| psa3'
98行目: 98行目:
 
| Bryophytes
 
| Bryophytes
 
|-
 
|-
| rps4
+
|''rps4''
 
| Reverse
 
| Reverse
 
| rps4_602Fn (<strike>psa4_602Fn</strike>)
 
| rps4_602Fn (<strike>psa4_602Fn</strike>)
105行目: 105行目:
 
| Bryophytes
 
| Bryophytes
 
|-
 
|-
| rps4
+
|''rps4''
 
| Reverse
 
| Reverse
 
| rps4_605Rmas
 
| rps4_605Rmas
112行目: 112行目:
 
| Bryophytes
 
| Bryophytes
 
|-
 
|-
| rps4
+
|''rps4''
 
| Reverse
 
| Reverse
 
| rps4_578Ri
 
| rps4_578Ri
119行目: 119行目:
 
| Bryophytes
 
| Bryophytes
 
|-
 
|-
| rps4
+
|''rps4''
 
| Reverse
 
| Reverse
 
| rps4_531Rmas
 
| rps4_531Rmas
126行目: 126行目:
 
| Bryophytes
 
| Bryophytes
 
|-
 
|-
| rps4
+
|''rps4''
 
| Reverse
 
| Reverse
 
| rps4_305Rmas
 
| rps4_305Rmas

2016年1月1日 (金) 01:36時点における版

広島大学 > デジタル自然史博物館 > 植物 > コケ植物(蘚苔類) > 情報

PCR primers

chloroplast

rps4

Table. Primers used for PCR amplification and sequencing
Analyzed region Forward / Reverse Primer name Sequence (5'–3') References For
rps4 Forward rps5 ATGTCCCGTT ATCGAGGACC T Nadot et al. (1994) Bryophytes
rps4 Forward rps4_1R ATGTCCCGTT ATCGAGGACC TCGTGTA Inoue et al. (2012) Bryophytes
rps4 Forward rps4_2Fmas TGTCCCGTTA TCGAGGACC Masuzaki et al. (2010) Bryophytes
rps4 Forward rps4_19Fi CCTCGTGTAA GAATAATACG TC Inoue & Tsubota (2014) Bryophytes
rps4 Forward rps4_275Fmas AGATAATGTG ATCTTTCGAT TAGGTATGGC Masuzaki et al. (2010) Bryophytes
rps4 Forward rps4_347Fmas CAATTGGTTA ATCATAGACA Masuzaki et al. (2010) Bryophytes
rps4 Forward rps4_553Fmas CAAACGATTA ATCGTGAATG GA Masuzaki et al. (2010) Bryophytes
rps4 Reverse psaA340F CTTGAGCACT AGGTTTAATA TGAGTAGGAT CA Inoue et al. (2012) Bryophytes
rps4 Reverse trnS (syn. trans) TACCGAGGGT TCGAATC Souza-Chies et al. (1997), Buck et al. (2000) Vascular plants (Souza-Chies et al. 1997), Bryophytes (Buck et al. 2000, as trans)
rps4 Reverse rps4_609RL TTAAGCTTGA CGAGAATAAT ATTC Masuzaki et al. (2010) Bryophytes
rps4 Reverse psa3' ATATTCTACA ACTAACAACT C Nadot et al. (1994) Bryophytes
rps4 Reverse rps4_602Fn (psa4_602Fn) TGACGAGAAT AATATTCTAC AACTA Inoue & Tsubota (2014) Bryophytes
rps4 Reverse rps4_605Rmas ACTTGGCGAG AATAATATTC AAC Masuzaki et al. (2010) Bryophytes
rps4 Reverse rps4_578Ri CGAGAATAAT ATTCTACAAC TA Inoue & Tsubota (2014) Bryophytes
rps4 Reverse rps4_531Rmas TCCATTCACG ATTAATCGTT TG Masuzaki et al. (2010) Bryophytes
rps4 Reverse rps4_305Rmas GCCATACCTA ATCGAAAGAT CACATTATCT Masuzaki et al. (2010) Bryophytes

References


デジタル自然史博物館 / 広島大学 / 植物 / コケ植物(蘚苔類) / 情報 にもどる