MacOSXLionMrBayes-MPI

提供: 広島大学デジタル博物館
2012年1月5日 (木) 21:46時点におけるChubo (トーク | 投稿記録)による版 (→‎プログラムの動作)
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Mac OS X Lion上でMrBayes-MPI

用意するもの

  • openMPIの動作する環境
    • XCodeなどをあらかじめインストール
      • gccやautotoolsが入っていれば良い
    • finkやMacPortなどでopenMPIをあらかじめインストールしておく
      • port search foo
      • sudo port install foo
    • Beagle-libが入っているとなおベター（とりあえずスキップ）
  • MrBayes 3.2のソースコード
    • ソースコードと一緒にあるCompileInstructions.txtに詳細あり

コンパイル

  • autoconf
  • ./configure --enable-mpi=yes --with-beagle=no
  • make

プログラムの動作

  • mpirun -np 16 mb foo.nex
    • 動いているかどうかはpsやアクティビティモニタで確認できる
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